خوارزمية تقدّر حدوث تغيرات سرطانية بالتَّخلُّق المتوالي

داخل نواة الخلية ، يقوم الحمض النووي DNA بتغليف البروتينات المعروفة بالهستونات ضمن بنية الكروموسومات. يمكن للإنزيمات أن تعدّل هذه الهستونات بشكل شاذّ، مسببة إسكات بعض الجينات المنتجة للبروتينات الكابحة للسرطان. الآن، وضع فريق بحث دولي نموذجا حاسوبيا يمكنه الكشف عن تعديلات الهيستون في كروموسومات الخلايا السرطانية، ونشروا النتائج التي توصّلوا إليها في دورية Bioinformatics .

هذا النموذج، المعروف باسم "تعديلات الهيستون في السرطان (HMCan)"، هو خوارزمية تحلّل التعديلات التي طرأت على الهيستون وتحدّدها. ويستعمل لتقدير عدد التعديلات الطارئة على الجينات في جينوم الخلايا السرطانية باستخدام بيانات تسلسل الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP-Seq)، وهي الطريقة التي تحلّل التفاعلات بين البروتينات والحمض النووي.

لاختبار فعالية نموذج HMCan ، قام الباحثون في كل من جامعة الملك عبد الله للعلوم والتكنولوجيا (KAUST)، في ثول، المملكة العربية السعودية، ومعهد كوري في باريس، والمدرسة الوطنية العليا للمناجم في باريس Mines ParisTech، بعقد مقارنة بينه وبين ثلاث أدوات أخرى تستخدم بالفعل لتحليل البيانات في الجينومات الطبيعية. تمكّن نموذج HMCan من الكشف عن علامات تعديلات الهيستون في جينومات السرطان المقلّدة بطريقة أفضل من الأدوات الثلاث كلها.

ثم تم اختبار HMCan على خلايا مزروعة من سرطان المثانة، حيث "قدم نتائج أفضل من الأدوات الثلاث في تحديد تعديلات الهيستون"، استنادا إلى فالنتينا بوفا، الباحثة المشاركة في الدراسة.

هذه الخوارزمية قد تسمح للأطباء بالكشف عن تعديل الهيستون، الذي قد يكون مفيدا في تصميم أدوية مضادة للسرطان تلغي هذه التغييرات السرطانية.

اشترك للحصول على النشرة الإلكترونية المحدّثة كل أسبوعين لكي تبقى على اطلاع بكافة المستجدات على الموقع.